Χαμένοι σε έναν ψηφιακό κόσμο, ο μόνος τρόπος να επιστρέψουν οι Νίντζα σπίτι τους είναι να συνεχίσουν να παίζουν στην Πρώτη Αυτοκρατορία – ένα βιντεοπαιχνίδι που έχει κυριολεκτικά κατακτήσει όλο τον κόσμο. Οι Νίντζα πρέπει να κερδίσουν περισσότερους πόντους για να ανέβουν επίπεδο. Ο Τζέι, η Νία, ο Κάι, ο Κόουλ και ο Λόιντ αποφασίζουν να χωριστούν σε ομάδες για να κερδίσουν. Θα φτάσουν άραγε με αυτό τον τρόπο πιο κοντά στον στόχο τους, να σώσουν τον κόσμο και να αντιμετωπίσουν τον απαίσιο Ουναγκάμι;